Un jour, Nobita choisit une petite fusée d’où sort un extraterrestre humanoïde de petite taille nommé Papi. Il vient sur Terre d’une planète nommée Pirika pour échapper à son armée maléfique PCIA. Au début, Doraemon et ses amis sont confus par la petite taille de Papi, mais avec le gadget « Small Light », ils rétrécissent et jouent ensemble. Cependant, le cuirassé en forme de baleine qui poursuivait Papi vient sur Terre et les attaque. Papi se reproche d’avoir impliqué tout le monde mais tente de se battre contre l’armée pcia. Afin de protéger Papi et sa planète, Doraemon et ses amis se rendent à Pirika.